In quasi ogni Cantone venne inoltre instaurata una «tregua» politica durante la quale i partiti politici cessarono provvisoriamente  le loro liti e si attennero alla linea del Governo. Tale tregua caratterizzò di riflesso anche le elezioni che si svolsero in quel periodo: praticamente non vennero condotte campagne elettorali e i cambiamenti nell’attribuzione delle preferenze ai partiti furono di conseguenza esigui. 

Anche nel 1939 il Parlamento svizzero conferì i pieni poteri per la protezione del Paese al Consiglio federale. Fra le misure adottate in base ai nuovi poteri ottenuti, il governo decise la mobilitazione dell’esercito.

Il contesto politico era fortemente influenzato dagli eventi all’estero: come già avvenuto durante la Prima guerra mondiale, la situazione di minaccia ridusse il divario tra borghesi e socialisti; questi ultimi abbandonarono le loro esigenze socialrivoluzionarie avvicinandosi ai primi a sostegno della difesa nazionale. 

Rispetto alle elezioni del 1935, nel 1939 non si constatarono grandi cambiamenti sul piano delle forze elettorali. Le elezioni ebbero normalmente luogo il 29 ottobre e per i militari venne organizzata l’infrastruttura necessaria. Questa volta si svolsero comunque elezioni tacite nei Cantoni di Lucerna, Svitto, Zugo, Soletta, Appenzello Esterno, Ticino, Vaud, Vallese e Neuchâtel.

Due consiglieri di Stato del Cantone di Basilea Campagna, Hugo Gschwind (KK) e Walter Hilfiker (SP), furono eletti nel 1939 in Consiglio nazionale. Dato che un solo membro dell’esecutivo cantonale poteva essere eletto nella Camera bassa, si procedette al sorteggio, vinto da Hugo Gschwind.